新杨黑羽蛋鸡育雏期肠道菌群定植规律分析

李红; 颜瑶; 詹凯; 刘伟; 马瑞钰; 涂盈盈; 严华祥; 《上海畜牧兽医通讯 》 2023

摘要：为进一步对新杨黑羽蛋鸡生产技术集成提供技术支持,分别对1日龄和3周龄雏鸡鸡粪中的微生物进行群落全长16SrDNA单分子测序,对其肠道高丰度菌群及其功能进行分析、预测.实验结果显示:从1日龄雏鸡粪便样品中共获得119个运算分类单元(operational taxonomic unit,OTU),检测到58种细菌;从3周龄雏鸡粪便样品中获得1 573个OTU,检测到176种细菌;1日龄和3周龄雏鸡肠道菌群间的丰富度指数Chao1、ACE及多样性指数Simpson存在极显著差异(P<0.01),但多样性指数Shannon差异不显著(P>0.05);1日龄雏鸡的肠道菌群中,相对丰度较高的5种优势菌分别为宋氏志贺菌、红色皱纹单胞菌、维氏气单胞菌、梭状芽孢杆菌和阴沟肠杆菌;3周龄雏鸡的肠道菌群中,相对丰度较高的5种优势菌分别为费格森埃希菌、宋氏志贺菌、不溶菌厌氧支原体、Spiroplasma apis和化糖梭状芽孢杆菌.

关键词： 新杨黑羽蛋鸡 肠道微生物 16S rDNA 测序

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